2011

• Το ελληνικό Ναυτικό στους Βαλκανικούς Πολέμους, 1912-1913, Ημερολγόγιο 2011, Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα & Έφεσος

2010

• Το Μαύρο’ 97, , Ημερολόγιο 2010, Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα & Έφεσος
• Ioannis D. Stefanidis, Vlasis Vlasidis, Enagelos Kofos, (ed.), Macedonian Identities through time interdisciplinary approaches, Research Center for Macedonian History & Documentation, 2010

2009

• Η μακρόχρονη πορεία προς την ελευθερία, Ημερολόγιο 2009, Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα & Έφεσος
• Σοφία Αλεξανδρίδου (επιμ. Β΄αναθεωρημένης έκδοσης) Οι απαρχές του Μακεδονικού Αγώνα (1903-1904). 100 έγγραφα από το Αρχείο του Υπουργείου των Εξωτερικών της Ελλάδας, Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα, 2009
• Σοφία Αλεξανδρίδου (επιμ. Β΄αναθεωρημένης έκδοσης) Η ελληνική αντεπίθεση στη Μακεδονία (1905-1906). 100 έγγραφα από το Αρχείο του Υπουργείου των Εξωτερικών της Ελλάδας, Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα, 2009

2008

• Λεύκωμα Φωτογραφιών, Στη Μακεδονία πριν από εκατό χρόνια (1908): Προσδοκίες και Ψευδαισθήσεις, Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα & Έφεσος, 2008
• Ιωάννης Στεφανίδης, Βλάσης Βλασίδης, Ευάγγελος Κωφός (επιμ.), Μακεδονικές Ταυτότητες στο χρόνο. Διεπιστημονικές προσεγγίσεις, ΚΕΜΙΤ, 2008

2007

• Ημερολόγιο 2007, Η Μακεδονία την εποχή του Μεγάλου Πολέμου 1914-1918, Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα & Έφεσος

2006

• Κέντρο Έρευνας Μακεδονικής Ιστορίας και Τεκμηρίωσης, ΜΑΚΕΔΟΝΙΑ: Ένας ελληνικός όρος σε σύγχρονη χρήση, ΚΕΜΙΤ, 2006
• Π. Καραμπάτη, Μουσειοσκευή: Ο Μακεδονικός Αγώνας στο Βάλτο των Γιαννιτσών, ΄Ιδρυμα Μουσείου Μακεδονικού Αγώνα, 2006
• Α. Κουκούδης, Η κοινωνική ζωή στα Βλαχοχώρια της Μακεδονίας στα 1900, Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα, 2006
• Τα παιδιά της Μακεδονίας, Ημερολόγιο 2006, Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα & Έφεσος

2005

• E. Kofos, V. Vlasidis (επιμ.), Athens-Skopje. An uneasy symbiosis, Athens, 2005, ISBN 960-8356-05-9
• Η μακεδονική κοινωνία στις αρχές του εικοστού αιώνα, Ημερολόγιο 2005, Αθήνα, εκδ. Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα & Έφεσος, 2005
• Περσεφόνη Καραμπάτη (επιμ.), Η Μακεδονία του Παύλου Μελά. Αγώνας και διλήμματα, Θεσσαλονίκη, εκδ. Κυρομάνος, 2005
• Research Centre for Macedonian History and Documentation, ΜΑΚΕΔΟΝΙΑ: A Greek term in Modern Usage, KEMIT, 2005

2004

• Ντίνος Χριστιανόπουλος, Ο Παύλος Μελάς σε ποιήματα Μακεδόνων ποιητών, Θεσσαλονίκη, εκδ. Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα & Κυρομάνος, 2004
• Λεύκωμα Χαρτών Χαρτογραφώντας τη Μακεδονία 1870-1930, Θεσσαλονίκη, εκδ. Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα & Εθνική Χαρτοθήκη, 2004
• Λεύκωμα Φωτογραφιών Στα σχολεία του Μακεδονικού Αγώνα, Αθήνα, εκδ. Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα & Έφεσος, 2004
• Β. Χατζηγεωργίου-Χασιώτη, Αποτυπώσεις του Μακεδονικού Αγώνα στη Νεοελληνική Πεζογραφία. Γραμματολογική Προσέγγιση και Ανθολόγηση, Θεσσαλονίκη, 2004, ISBN 960-12-1332-5
• Β. Γούναρης, Ι. Μιχαηλίδης (επιμ.), Πρόσφυγες στα Βαλκάνια. Μνήμη και ενσωμάτωση Αθήνα, 2004, ISBN
• Β. Νικόλτσιος, Β. Βλασίδης, 65+1 Ιστορικά Μουσεία της Ελλάδας, Θεσσαλονίκη, εκδ. Σωματείο «Οι Φίλοι του Μουσείου Μακεδονικού Αγώνα», 2004

2003

• Ε. Κωφός, Βλ. Βλασίδης (επιμ.), Αθήνα-Σκόπια. Η επτάχρονη συμβίωση, Αθήνα, 2003, ISBN 960-02-1705-X

2002

• Λεύκωμα Φωτογραφιών, Στη Μακεδονία του 1908 (από τη συλλογή Α. Γ. Παπαϊωάννου), Θεσσαλονίκη, 2002 ISBN

2000

• Π. Γ. Καραμπάτη, Μαχόμενα σύμβολα. Οι σφραγίδες των Μακεδονομάχων Αγωνιστών, Θεσσαλονίκη, 2000 ISBN

1998

• Π. Γ. Καραμπάτη, Π. Γ. Κολτούκη, Ι. Δ. Μιχαηλίδης, Φ. Ι. Τολούδη (επιμ.), Β. Κ. Γούναρης (εισαγ.), Η τελευταία φάση της ένοπλης αναμέτρησης στη Μακεδονία (1907-1908). 100 έγγραφα από το Αρχείο του Υπουργείου των Εξωτερικών της Ελλάδος, Θεσσαλονίκη, ISBN
• Κ. Κωφός, Εθνική κληρονομιά και εθνική ταυτότητα, Θεσσαλονίκη, 1998, ανάτυπο από Θάνος Βερέμης (επιμ.), Εθνική Ταυτότητα και Εθνικισμός στη Νεότερη Ελλάδα, μτφρ. Γιάννης Στεφανίδης, Αθήνα, Μορφωτικό Ίδρυμα Εθνικής Τράπεζας, 1997.

1997

• Β. Κ. Γούναρης, Ι. Δ. Μιχαηλίδης, Γ. Β. Αγγελόπουλος (επιμ.), Ταυτότητες στη Μακεδονία, Αθήνα, 1997, ISBN 960-02-1206-6
• Π. Γ. Καραμπάτη, Π. Γ. Κολτούκη, Ι. Δ. Μιχαηλίδης (επιμ.), Β. Κ. Γούναρης (εισαγ.), Η ελληνική αντεπίθεση στη Μακεδονία (1905-1906). 100 έγγραφα από το Αρχείο του Υπουργείου των Εξωτερικών της Ελλάδος, Θεσσαλονίκη, 1997.

1996

• Π. Γ. Καραμπάτη, Π. Γ. Κολτούκη, Χ. Μ. Μανδατζής, Ι. Δ. Μιχαηλίδης, Α. Α. Χοτζίδης (επιμ.), Β. Κ. Γούναρης (εισαγ.), Οι απαρχές του Μακεδονικού Αγώνα (1903-1904). 100 έγγραφα από το Αρχείο του Υπουργείου των Εξωτερικών της Ελλάδος, Θεσσαλονίκη, 1996.
• Α. Χοτζίδης, Ευθύμιος Καούδης. Απομνημονεύματα, Θεσσαλονίκη, 1996.

1993

• D. Dakin, The Greek Struggle in Macedonia (1897-1913), Θεσσαλονίκη, επανέκδοση, α' έκδοση: Θεσσαλονίκη, Ίδρυμα Μελετών Χερσονήσου του Αίμου, 1966.
• Β. Κ. Γούναρης, Α. Παναγιωτοπούλου, Α. Χοτζίδης (επιμ.), Τα γεγονότα του 1903 στη Μακεδονία μέσα από την ευρωπαϊκή διπλωματική αλληλογραφία, Θεσσαλονίκη, 1993.
• B. C. Gounaris, A. Panagiotopoulou, A. Chotzidis (eds), The Events of 1903 in Macedonia, as Presented in European Diplomatic Correspondence, Thessaloniki, 1993.
• Ε. Κωφός, Το Όραμα της «Μεγάλης Μακεδονίας», Θεσσαλονίκη, 1993.
• E. Kofos, The Vision of "Greater Macedonia", Thessaloniki, 1993
• E. Kofos, Die Vision eines "Grossmazedonien", Thessaloniki, 1993
• E. Kofos, Het Visioen van een "Groot-Macedonie", Thessaloniki, 1993
• E. Kofos, La Visione della "Grande Macedonia", Salonicco, 1993
• E. Kofos, La Reve de la "Grande Macedoine", Thessaloniquei, 1993
• E. Kofos, La Visión de la "Gran Macedonia", Tesalónica, 1993

1992

• Β. Γούναρης (επιμ.), Το Ανέκδοτο Ημερολόγιο του Μακεδονομάχου Ευθυμίου Καούδη, Θεσσαλονίκη, 1992.

1989

• Ν. Ανδριώτης, Το Ομόσπονδο Κράτος των Σκοπίων και η γλώσσα του, Θεσσαλονίκη, επανέκδοση.

1987

• Συμπόσιο «Ο Μακεδονικός Αγώνας», Θεσσαλονίκη, Ίδρυμα Μελετών Χερσονήσου του Αίμου - Μουσείο Μακεδονικού Αγώνα, 1987.

1984

• Στ. Αποστολάκης, Οι Μακεδονομάχοι μας στη δημοτική ποίηση, Θεσσαλονίκη, 1984.
• Π. Κανελλόπουλος, Το ιστορικό νόημα του Μακεδονικού Αγώνα, Αθήνα, Οι Φίλοι του Μουσείου του Μακεδονικού Αγώνα, 1984.
• Γ. Μόδης, Iππότες του Σταυρού. Eκλεκτά διηγήματα, επιμ. Kώστα Kαφαντάρη, Aθήνα, Eστία - Mουσείο του Mακεδονικού Aγώνα, 1984.